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利用RNA


山羊 c-Myc 原癌基因克隆、 原核表达和 GST-Myc融合蛋白纯化 Cloning and Prokaryotic Expression of Goat c-Myc Proto-oncogene, and Purification of GST-Myc Fusion Protein USA, 82: 7232~7236 Murphy M.J., Wilson A., and

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pluripotent stem cells from adult human fibroblasts by defined factors, Cell, 131: 1~12 Takahashi K., and Yamanaka S., 2006, Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined faaors, Cell, 126(4): 663~676 Thompson B.E., 1998, The many roles of c-Myc in apoptosis, Annual Review of Physiology, 60:575~600 Yano T., Sander C.A., Clark H.M., Jaffe E.S. and Raffeld M., 1993, Clustered mutations in the second exon of the Myc gene in sporadic Burkitt's lymphoma , Oncogene, 8 (10): 2741~2748 Zhu W., and Zhu J.Q., 2001, In vitro homodimerization of C-terminus of c-Myc protein at high concentration, Nanjing Daxue Xuebao(Ziran Kexue)(Journal of Nanjing University (Natural Sciences)), 37(5): 551~556(朱微, 朱剑琴, 2001, 南京大 高浓度 c-Myc 羧基端的体外自身二聚体化活性, 学学报(自然科学), 37(5): 551~556)

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利用 RNA-seq 法对人真菌病原体白色念珠菌转录组进行广泛注释

Comprehensive Annotation of the Transcriptome of the Human Fungal Pathogen Candida albicans Using RNA-seq
白色念珠菌(Candida albicans)是侵袭人类的主要真菌病原体, 从表面粘膜感染到不断散播引起系统性感染而引起多种疾 病通常都是致命的, 它引起疾病是依靠其适应不同的环境刺激来改变自身的转录组水平以确保在不同的宿主环境下生存。耶 鲁大学、 斯坦福大学和美国能源部联合基因组研究所的研究人员通过测序手段发现了白色念珠菌大量新的转录活性区域和新 的内含子。这一研究结果发表在 《Genome Research》 上。 研究人员在 9 种不同的体外条件下培养白色念珠菌(菌株 SC5314), 提取总 RNA 后纯化出 poly(A) mRNA, 通过高通量的 RNA-seq 法构建了一个不同条件下白色念珠菌转录组高分辨率图谱。运用 RNA-seq 数据集, 通过确定不同转录本在基因组中 位置进一步精炼了白色念珠菌的主要基因组信息注释, 鉴定了 602 个新的转录活性区域和 41 个新的内含子。有趣地是, 许多 新鉴定的转录活性区域是受环境条件特异性的方式调节的。研究人员将获得数据进行了聚类分析和功能富集分析, 并用实时 荧光定量 PCR 的方法对其中的 41 个基因(包括 26 个新转录本和 15 已注释转录本)进行了验证。这些结果不仅增加了对白色 念珠菌现有基因组信息的注释, 也为更全面地理解其发病机理的分子机制提供必需的基础资料。 编者: 王志伟、 应正宙(中国农业科学院北京畜牧兽医研究所), 本刊通讯员 本文引用格式: 王志伟、 应正宙, 2010, 利用 RNA-seq 法对人真菌病原体白色念珠菌转录组进行广泛注释, 农业生物技术学报, 18(5): 937 信息来源: http://genome.cshlp.org/content/early/2010/08/31/gr.109553.110.long


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